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Un sistema di trasporto ligure si sviluppa in un contesto infrastrutturale abbastanza problematico, con delle specificità date sia dalla morfologia del territorio, sia dalla localizzazione delle linee, particolarmente tortuose e caratterizzate dalla presenza di numerose gallerie. Tali condizionamenti, insieme alla vetustà delle linee e all'incompletezza di alcuni segmenti ancora a binario unico, influenzano notevolmente il livello e la qualità del traffico ferroviario.

In liguria sono presenti tre distinte reti infrastrutturali ferroviarie, senza connessione tra le stesse:

• la rete ferroviaria regionale, di proprietà statale e in gestione a Rfi 
• la ferrovia Genova – Casella, di proprietà della Regione Liguria; 
• la ferrovia elettrica Principe – Granarolo, di proprietà della Regione Liguria.